Служение
Святейший Синод 
Должность Столоначальник Хозяйственного управления Святейшего Синода 
Год начала 1904 
Год окончания 1918 
После окончания Духовной Академии остался служить в столице при Святейшем Синоде
в Хозяйственном управлении.
Перед революцией он имел чин надворного советника и занимал там должность
столоначальника.
Он живо интересовался жизнью родного города, губернии и своих предков.
Его первая публикация в "Псковских епархиальных ведомостях" за ноябрь 1908г.
была посвящена празднованию в Порхове 50-летия отца.
С 6 февраля 1909г. Михаил Лебедев являлся действительным членом Псковского
церковного историко-археологического комитета и принимал активное участие
в его научной работе.
Михаил Лебедев взялся за поиски псковских материалов в архиве Синода.
Их результаты регулярно печатали "Псковские епархиальные ведомости"
в 1909–1917гг.
Много его статей посвящено изучению истории родной Псковской духовной семинарии
Статьи М.Лебедева печатались в Трудах Псковского церковного Историко-археологического
Комитета.
Он призывал Псковских исследователей самим взяться за поиск новых документов.
Призыв не был услышан.
В сдвоенном N 6–7 журнала за 1917г, уже после Февральской революции, появилась
еще одна статья Лебедева под заглавием "К истории Псковской духовной семинарии".
В ней изложена биография архимандрита Иннокентия, ставшего ректором семинарии в 1824г.
Однако Михаил Лебедев, изучая дела синодального архива, не ограничился
изысканиями только по истории родной семинарии.
В "ПЕВ" за 1912г. была напечатана его статья "Преподобный Иоасаф, игумен
Снетогорский", "Библиографическая заметка" в N 20 тех же Ведомостей за 1912г. о новой книге
краеведа Л.Софийского "Город Опочка и его уезд в прошлом и настоящем",
"Епархиальные архитекторы, их права и обязанности" и др.
Главное внимание Михаил Лебедев уделял истории учебных заведений епархии.
Статьи его в ПЕВ за 1910–1912гг. посвящены родному Порховскому духовному училищу.
М.Е.Лебедеву принадлежала идея создания юбилейного фонда училища.
14 января 1913г. года он послал письмо в правление училища от имени выпускников 1894
года и их денежный перевод на 76 рублей, заложивший основу этого фонда.
Тогда же, в начале 1913г., Лебедев приступил к работе над
книгой "История Порховского духовного училища (1814–1914 гг.)".
В следующем году ее отпечатали в столице за счет Порховского епархиального управления.
Пять страниц посвящены роли его отца, как члена правления училища и
председателя съезда духовенства Порховского учебного округа, привел и
краткую биографию преподавателя училища, своего брата Владимира