Аресты
Казахстан, Восточно-Казахстанская (Семипалатинская) о., Бескарагайский р., пос.Семиярск 
Год ареста 1937 
День ареста 15 
Месяц ареста 11 
В августе или в сентябре 1937г. в райотдел НКВД Семиярска поступила директива об
оформлении следственных дел на проживающих в поселке сосланных священников.
Были подобраны "свидетели" деятельности "к/р группы священников, возникшей в
Семиярске".

Вскоре о.Иоанн, а также другие 5 проживавших в Семиярске священников, в том числе
священник Михаил Дмитриевич Канделинский, были арестованы
Осуждения
тройка при УНКВД СССР по Восточно-Казахстанской обл. 
25/11/1937 
Обвинение "участие в к/р группе церковников, систематическая а/с агитация, клеветнические измышления о Соввласти и выборах в Верховный Совет, нелегальные богослужения на квартире" 
Приговор высшая мера наказания — расстрел 
Групповое дело "Дело к/р группы церковников. Семипалатинская о., пос.Семиярск, 1937г." 
По делу проходили, кроме о.Иоанна, еще пять ссыльных православных священников:
о.Владимир Иванович Воробьев, о.М.С.Прокопьев, о.Феодосий С.Никольский,
о.Л.М.Багрецов, о.М.С.Прокопьев, а также С.С.Телятников (баптист) и Т.Г.Багрянцев.
Из обвинительного заключения:
   "Находясь в ссылке в с.Семиярск Бескарагайского района, систематически проводили
    а/с агитацию, организовав в этих целях контрреволюционную группу. Часто
    общались между собой и вели разговоры, что в Семиярске скоро будет работать
    церковь. Заявляли, что выборы являются обманом".

О.Иоанн виновным себя не признал, как и остальные обвиненные по этому делу.
В протоколе допроса о.Иоанна против некоторых ответов на вопросы следователя
рукой о.Иоанна написано: "Не согласен". И ниже: "Никаких контрреволюционных
действий в Семиярске я не проводил. Протокол подтверждаю". И далее — подпись.
Сначала дело рассматривалось Бескарагайским РО УНКВД. Оно было закончено
22 ноября 1937г., 23 ноября 1937г. было составлено обвинительное заключение,
24 ноября доставлено в Семипалатинск, а 25 ноября вынесено на заседание тройки.
Всем шести обвиненным по делу православным священникам был вынесен приговор
о расстреле, как и проходившему по тому же делу баптисту С.С.Телятникову.
(Приговор восьмому обвиняемому — Т.Г.Багрянцеву, был 10 лет ИТЛ)
Места заключения
Казахстан, г.Семипалатинск, тюрьма 
Год начала 1937 
День начала 24 
Месяц начала 11 
Год окончания 1937 
День окончания 28 
Месяц окончания 11