Аресты
Марийская АО, г.Краснококшайск (Царевококшайск, Йошкар-Ола) 
Год ареста 1923 
В конце 1923г. власти затеяли новый процесс над насельниками Мироносицкой пустыни,
и о.Рафаил вновь оказался в числе обвиняемых в сокрытии
"подлежащих изъятию" церковных ценностей, распространении религиозной литературы
Осуждения
Марийский облсуд 
./02/1924 
Обвинение "расхищение церковных ценностей, распространение религиозной литературы" 
Статья ст.80 ч.1,120 УК РСФСР 
Приговор 4 года заключения с лишением права пребывания в Марийской АО в течение трех лет после отбытия наказания 
Дело рассматривалось Марийским областным судом в феврале 1924г.
О.Рафаил был приговорен к четырем годам заключения и лишен права пребывания
в МАО в течение трех лет после отбытия наказания
Места заключения
Марийская АО, г.Краснококшайск (Йошкар-Ола), Краснококшайский ИТД N 1 
Год начала 1923 
Год окончания 1924 
День окончания 22 
Месяц окончания 9 
До 22 сентября 1924г. о.Рафаил находился в Краснококшайском ИТД N 1, где
работал пекарем.
Согласно приказу по ИТД от 22 сентября 1924г. о.Рафаил был снят с должности
пекаря и переведен в ИТД N 2
Марийская АО, г.Краснококшайск (Йошкар-Ола), ИТД N 2 
Год начала 1924 
День начала 22 
Месяц начала 9 
Год окончания 1924 
День окончания 6 
Месяц окончания 10 
Нижний Новгород, Нижегородский ИТД 
Год начала 1924 
День начала 6 
Месяц начала 10 
Впоследствии приказом от 6 октября 1924г. вместе с архимандритом
Варсонофием (Никитиным) и иеродиаконом Иннокентием (Кулединым), также
впоследствии архимандритом, о.Рафаила перевели в Нижегородский ИТД.
Согласно имеющимся сведениям, о.Рафаил находился в заключении
два года, а затем уехал на родину