Осуждения
тройка при ПП ОГПУ по Московской обл. 
28/06/1931 
Обвинение "руководство к/р группировкой церковников, ведущей ярую а/с агитацию с целью восстановления царского строя" 
Статья ст.58–10–11 УК РСФСР 
Приговор 5 лет концлагерей с заменой на высылку в Казахстан на тот же срок 
Групповое дело "Дело священника о.Иоанна (Протопопова), схиархимандрита Андроника (Лукаша) и других священнослужителей и монахинь Калуги, г.Калуга, 1931г." 
На допросе 29 мая 1931г. показал, что "служил в Калужском женском монастыре, игуменией
  была Ангелина Гуляева. С 1917г. монастырь лишился угодий, что было монахинями встречено
  недоброжелательно. В монастыре была организована швейная артель. В 1922г. монастырь
  был закрыт, монахини, живя по разным квартирам, старались объединиться вокруг
  игумении и вокруг церкви св.Георгия за лавками, куда перешел и диакон монастыря.
  В конце 1922г. церковь св.Георгия была закрыта, и община перешла в церковь Богоявления.
  Часть монахинь заняла свободные места сторожих, псаломщиц, регентов в других
  церквях Калуги и губернии.
  Иеромонах из Лаврентьевского монастыря под Калугой, служащий в Алексеевской церкви,
  восприемник идей старца этого монастыря о.Нила, умершего в 1915г., руководившего,
  как старец, монахами 4-х монастырей Калужской губернии (Лаврентьевского, Белокопытовского,
  Калужского женского и Никольского), стал вести работу по созданию группы старцев
  в Калуге. Организация старчества преследует цель объединения всего монашества
  под одно руководство, взаимопомощь, помощь страждущим братьям.
  В феврале 1931г. в Калугу приехал иеромонах Андроник, который также вел работу по
  объединению монашества.
  Монахиня Евдокия Новикова занималась сбором средств для высланных и
  осужденных".

На допросе 8 июня 1931г. о.Иоанн виновным себя не признал, "так как никакой
  деятельности по организации нелегальной общины не вел. Пользуется среди монахинь
  авторитетом, как бывший монастырский священник и старший среди всего духовенства
  Калуги. Игумению Ангелину посещал, никакой а/с деятельности не вел, открыто
  недовольство высказал однажды по поводу непосильного налогообложения.
  Со священником Зарецким был связан только по службе"