Осуждения
Выездная Сессия Военного Трибунала Войск НКВД Уральского округа 
30/08/1939 
Статья ст.17,58–8,58–10 ч.1 УК РСФСР 
Приговор 10 лет ИТЛ с конфискацией имущества и последующим поражение в правах сроком на 5 лет 
Архив УФСБ РФ по Республике Башкортостан. Д.ВФ-20305.
Из обвинительного заключения:
     "Вел бродячий образ жизни, в ряде деревень Юмагузинского района проводил
      нелегальные сборища верующих...
      В антисоветской форме истолковывал новую Сталинскую Конституцию".

30 августа 1939г. Военным Трибуналом Войск НКВД Уральского округа,
в закрытом судебном заседании выездной сессии в гор.Стерлитамаке БАССР,
о.Иоанн был осужден к 10 годам ИТЛ с конфискацией всего принадлежащего ему
имущества, с поражением в правах сроком на 5 лет.
В протоколе Суда указан как "священник-обновленец с 1917г. по день ареста".
Как указывает церковный исследователь Зимина Н.П. [Зв1]:
   "Не понятно совершенно, откуда эта фраза в тексте протокола (в редакции
    секретаря суда), предположительно, мог быть в обновленческом расколе
    в Оренбургской епархии в 1920-е годы, хотя это и надо доказывать.
    В составе Оренбургской епархии БЫЛ ПРАВОСЛАВНЫМ: по всем приходам служения
    ..., в выданной справке сельсовета от января 1937г. и православной ориентации
    родного отца, служившего недалеко, в с.Ново-Александровка Юмагузинского р-на,

    — как раз в тех местах, куда приходил о.Иоанн крестить детей после ареста
    отца — это селения отцовского староцерковного прихода!"