Осуждения
Особое Совещание при НКВД СССР 
03/09/1936 
Обвинение "к/р деятельность, руководитель к/р группы монахов и а/c хищнической группы священников-тихоновцев Никольской церкви, систематическая антисоветская агитация" 
Статья ст.58–10,58–11 УК РСФСР 
Приговор 3 года ИТЛ 
Групповое дело "дело епископа Александра (Толстопятова) и священника о.Иоанна Мальникова, Алма-Ата, 1936г." 
Владыка проходил сразу по двум уголовным делам: по "делу монахов" и по "делу
церковников-тихоновцев" (уголовные дела N 09550 и N 19955, архив КНБ
Республики Казахстан).
По следственному делу монахов епископ Александр проходил вместе с иеромонахом
Пахомием (Русиным), иеромонахом Макарием (Ермоленко) и др.
Из обвинительного заключения:
   "Проведенным следствием по делу контрреволюционной
    группы монахов и антисоветской хищнической группы церковников-тихоновцев
    Никольской церкви установлено, что практическое руководство и установки в
    контрреволюционной деятельности указанным группам давались епископом Толстопятовым.
    После революции бывший морской офицер царского флота Толстопятов переходит на
    церковную службу с целью "укрепления" церкви, причем в программу "укрепления"
    входила пропаганда контрреволюционных религиозных идей и активная борьба с
    материализмом как основой революционной теории. Сконцентрировал вокруг себя
    контрреволюционеров, преимущественно монашествующий элемент"